Trong phần 3 Sư tử Alex, ngựa vằn Marty, Hà mã dễ thương Gloria, và Hươu Cao cổ Melman vẫn còn chiến đấu để về được ngôi nhà thân yêu của mình Big Apple. vua Julien, Maurice và các chú chim cánh cụt vẫn sánh vai cùng trong các cuộc phiêu lưu. Lần này, cuộc thám hiểm sẽ đến châu Âu, nơi họ tìm thấy một vỏ bọc hoàn hảo thông qua một gánh xiếc đi du lịch mang đậm phong cách Madagascar
Hội quái siêu cấp chia sẻ lễ hội truyền thống Halloween của họ với Vida, sau đó được mời đến bữa tiệc Día de los Muertos ở sân sau của Howlers.
Là một chú chim cánh cụt được nuôi dạy bởi mẹ hổ, Maurice – chú Hổ Cánh Cụt cùng biệt đội rừng xanh của mình đã duy trì hòa bình và trật tự cho khu rừng rậm nơi mình sinh sống trong nhiều năm cho đến khi Gấu túi Igor - kẻ mà mục đích duy nhất trong đời là hủy diệt toàn bộ khu rừng, xuất hiện.
Mai là một cô bé "cô đơn" chuyên bị bắt nạt và không thích kết bạn với ai. Và rồi mẹ cô đã mua một con Robot gen 6 về cho cô, từ đó cả hai kết bạn và thân thiết với nhau. Một thời gian sau cô bị truy lùng bởi các nhà khoa học "điên" khi biết Robot gen 6 bạn của cô ẩn chứa một siêu vũ khí có thể hủy diệt loài người...
Thời hỗn độn sơ khai, yêu tinh đệ nhất thế giang giáng thế, tên Nguyên Đế, được tôn sùng là Yêu tổ. Trăm ngàn vạn năm sau, yêu vương ngày xưa Tôn Ngộ Không được Đường Tăng cứu ra khỏi núi Ngũ Hành Sơn, Ngộ Không đồng ý bảo vệ Đường Tăng đến Tây Thiên thỉnh kinh.